一、直沖式馬桶
直沖式馬桶是使用了水向下流動時產生的巨大的力量來排放臟污。一般池壁陡峭，儲水面積小。這樣，水力集中，圓周圍的水功率下降，沖水效率高。利用壓縮空氣形成的大推力，水很快被沖洗，沖量大，速度快，水少，漏氣不多。由于直沖式使用水流的瞬時強動能，因此撞擊管壁的聲音相對較大。后面的排水系統大部分是直的，水管直徑較大，容易沖下較大的污垢。
優點：直沖式的結構很簡單，就是一個沖水管，水的重力加速度都可以充分利用達到沖廁所的效果。在沖水的過程中不容易造成堵塞。在節水方面，馬桶下水方式選擇直沖式也比虹吸式更加節省。
缺點：直沖式廁所最大的缺點是沖水聲大，而且因為水面小，容易有鱗片，防臭工作就不如虹吸廁所。另外，馬桶下水方式設有直沖式的馬桶，目前市面上種類較少，選擇面也沒有虹吸式那么大。
二、虹吸式馬桶
虹吸式的下水管道是呈“∽”型的，排水管道注滿水后，會產生一定的水位差。廁所下水道管道的沖廁水產生的吸力會排出糞便。由于虹吸式廁所啟動方式不靠水流供電，池內記憶體的水面較大，沖廁噪音較少。
優點：虹吸式馬桶最大的特色就是沖水的時候聲音非常小。在沖廁所干凈的能力上，虹吸式也比直沖式更極容易沖洗干凈，并且抗臭效果比直沖式要好。市場上有很多種類的虹吸座椅，在馬桶下水方式的樣式功能上可以給你更多的選擇。
缺點：虹吸式馬桶沖水時，必須先將水排放到非常高的水面，然后沖洗污物。因此，需要有一定的水量才能達到清潔的目的，并且一次至少有8升到9升的水。因此，使用虹吸式這種馬桶下水方式在開銷上是相對昂貴的。虹吸式排水管直徑也約56厘米，沖水時容易堵塞。因此，廁紙不能直接扔進廁所。虹吸座椅的安裝一般也裝有紙籃和水籃。
近年來，由于虹吸式馬桶，安靜的聲音和強大的沖廁能力，大多數家庭在馬桶下水方式上選擇使用虹吸式來進項下水的馬桶。
