微波爐加熱是可以殺菌的，采用高火加熱的時候，溫度會迅速的達到250度左右，可以在很短的時間內就殺死大部分的細菌、病毒和微生物，消毒殺菌的效果還是比較好的。
一般情況下，微波爐可以對一些食物或者餐具來進行消毒和殺菌的處理，或者對一些毛巾也可以起到消毒和殺菌的效果。毛巾在殺菌的時候，一定要用水浸濕以后再進行加熱，否則容易發生一些燒糊的現象，就會損害毛巾。
再來微波爐加熱的時候要嚴格的按照說明書來進行使用，以免發生一些危險的情況。
除了加熱食物外，微波爐還有你不知道的效果之微波殺菌
微波殺菌是細菌由不同種化合物和水極性分子組成，微波可以加熱水和其它元素，使菌受熱升溫達到滅菌的效果，微波不能保鮮的，它只是快速加熱食物。微波滅菌是采用微波(頻率為300MHz~300000MHz)照射產生的熱能殺滅微生物和芽孢的方法。該法適合液體和固體物料的滅菌，且對固體物料具有干燥作用。
其特點是：微波能穿透到介質和物料的深部，可是介質和物料表里一致地加熱;且具有低溫、常壓、高效、快速(一般為2-3min)，低耗能、易操作、易維護，產品保質期長(可延長1/3以上)等優點。
微波殺菌原理
微波殺菌的機理在于，細菌、成蟲 與任何生物細胞一樣，是由水、蛋白質、核酸、碳水化合物、脂肪和無機物等復雜化合物構成的一種凝聚態介質。其中水是生物細胞的主要成分，含量在 75～85%，因為細菌的各種生理活動都必須有水參與才能進行，而細菌的生長繁殖過程，對各種營養物的吸收是通過細胞膜質的擴散、滲透和吸附作用來完成 的。
在一定強度微波場的作用下，物料中的蟲類和菌體也會因分子極化馳豫，同時吸收微波能升溫。由于它們是凝聚態物質，分子間的作用力加劇了微波能向熱能的能態轉化。從而使體內蛋白質同時受到無極性熱運動和極性轉動兩方面的作用，使其空間結構變化或破壞，而使蛋白質變性。蛋白質變性后，其溶解度、粘度、膨脹性、滲透性、穩定性都會發生明顯的變化，而失去生物活性。另一方面，微波能的非熱效應在滅菌中起到了常規物理滅菌所沒有的特殊作用。也是造成細菌死亡的原因之一。
